Установлено, что Клименко, злоупотребляя служебным положением, по предварительному сговору с другими должностными лицами Миндоходов, организовал в Одесской, Киевской, Донецкой и Харьковской областях так называемые "программные" предприятия, целью которых было оказание услуг по растаможке товаров на территории Украины по значительно заниженной таможенной стоимости. Отмечается, что принцип работы преступной схемы заключался в уклонении и минимизации уплаты налогов и сборов в Государственный бюджет Украины путем реального уменьшения веса груза с подделкой сопроводительных документов на груз, изменения в сопроводительных документах на груз классификации и кодов товаров на более дешевые, чем в реальности.
Кроме того, в ходе досудебного расследования установлено, что в течение 2012-2013 гг. Клименко по предварительному сговору с должностными лицами министерства и должностными лицами субъектов хозяйственной деятельности организовал деятельность на территории страны схемы уклонения от уплаты налогов предприятиями реального сектора экономики. Принцип работы этой схемы заключался в предоставлении указанным предприятиям возможности пользоваться услугами структур, которые были подконтрольны Клименко, с целью минимизации налоговых обязательств и незаконного формирования налогового кредита по НДС.
В результате незаконной деятельности указанных предприятий и самого Клименко, бюджету Украины нанесен ущерб на сумму более 6 млрд грн.
29 апреля в отношении Клименко вынесено уведомление о подозрении в совершении преступления, предусмотренного ч. 2 ст. 364 (злоупотребление властью или служебным положением) УК Украины.
Сейчас продолжаются мероприятия по установлению его места нахождения.